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科研进展

2008年9月我所邓兴旺实验室在《Molecular Plant》杂志上发表了题为“Integration of Cytological Features with Molecular and Epigenetic Properties of Rice Chromosome 4”的文章,报道了水稻4号染色体的结构,基因表达以及表观遗传的关联研究。

发布时间:2014/11/25

2008年9月我所邓兴旺实验室在《Molecular Plant》杂志上发表了题为“Integration of Cytological Features with Molecular and Epigenetic Properties of Rice Chromosome 4”的文章,报道了水稻4号染色体的结构,基因表达以及表观遗传的关联研究。

染色体是真核生物的遗传物质的载体,其结构在DNA复制以及基因的转录中有着重要的意义。形态学上的研究根据染色的深浅将染色质分为常染色质和异染色质,这两种不同的结构表现了DNA折叠的不同程度,影响着DNA复制和转录的活性。表观遗传学的研究表明染色质的形成与组蛋白修饰,DNA甲基化以及小RNA有关。这篇文章以水稻4号染色体为对象,用一个统计上的方法根据染色体上基因表达密度将4号染色体划分为与形态学特征相对应的常染色质和异染色质区域,免疫原位杂交实验的结果也支持了这种常、异染色质区的划分。表达芯片的数据表明常,异染色质区分别对应着相对较高和低的转录活性,ChIP实验也表明不同常、异染色质区中的基因有着不同的组蛋白修饰水平,并且跟基因的整体表达水平有着关联。文章揭示了染色质的结构和基因的整体表达水平之间有着紧密的关联,而表观遗传修饰在其中起着重要的作用。

    该论文的第一作者是我所技术员尹本亮,论文作者还包括我所郭兰博士和王向峰博士,中科院遗传发育所的张冬芬博士和程祝宽博士,Wilkes大学的William Terzaghi博士,和我所刘婷婷和何航同学。邓兴旺博士是该论文的通讯作者。此项研究由科技部863计划(2003AA 210070)和科技部863水稻功能基因组计划基金资助,主要工作在北京生命科学研究所完成。