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科研进展

2010年10月14日,我所叶克穷实验室在《Journal of Molecular Biology》杂志在线发表题为“Size-independent and noncooperative recognition of dsRNA by the Rice Stripe Virus RNA silencing suppressor NS3”的论文。该论文研究了水稻条纹叶枯病毒沉默抑制子NS3的结合双链RNA的生化机理。

发布时间:2010/10/14

20101014,我所叶克穷实验室在《Journal of Molecular Biology》杂志在线发表题为“Size-independent and noncooperative recognition of dsRNA by the Rice Stripe Virus RNA silencing suppressor NS3”的论文。该论文研究了水稻条纹叶枯病毒沉默抑制子NS3的结合双链RNA的生化机理。

siRNA介导基因沉默是植物重要的抗病毒机制,植物病毒通常编码RNA沉默抑制子以克服这种免疫机制。水稻条纹叶枯病毒的侵染是我国水稻减产原因之一,其编码的NS3蛋白是个RNA沉默抑制子。NS3可能通过结合siRNA发挥功能,但还不清楚NS3如何结合双链RNA。我们通过定量的生化分析以及定点突变和植物体内抑制RNA沉默活性分析,研究了NS3识别双链RNA的生化机理。我们的结果显示NS3蛋白是个稳定的同源二聚体,识别长度约为9个碱基对的双链RNA。当双链RNA的长度大于等于20个碱基对时,RNA能同时结合一个以上的NS3分子,但是多个NS3结合时并没有协同性。我们还利用定点突变发现一些可能参与结合RNA的氨基酸,利用RNA结合缺陷的突变体,发现NS3 结合RNA的能力和其抑制植物RNA沉默的能力是相关的。

本文的第一作者为我所沈梅,参与此工作的还有我所贾茹,浙江大学的徐毅和周雪平教授。我所研究员叶克穷博士是本文的通讯作者。该研究由科技部和北京市科委资助,在北京生命科学研究所和浙江大学完成。